Proteínas de Caenorhabditis elegans

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Clonado y expresión de proteínas de la vía de la dismutación del malato de Caenorhabditis elegans para el futuro desarrollo de drogas antihelmínticas

Clonado y expresión de proteínas de la vía de la dismutación del malato de Caenorhabditis elegans para el futuro desarrollo de drogas antihelmínticas

La manipulación molecular es una de las herramientas básicas más utilizadas en las ciencias biológicas. La mutagénesis y el clonado de ADN permiten, entre otras aplicaciones, la expresión de proteínas recombinantes. El clásico método de clonado dependiente de ligación (LDC), el cual se basa en la digestión mediante enzimas de restricción seguida de un paso de ligación entre el vector y el inserto de ADN, ha sido el más utilizado por varias décadas. Sin embargo, en los últimos años se han desarrollado una variedad de métodos alternativos de clonado independientes de ligación (LIC). Estos últimos han facilitado y expandido enormemente las aplicaciones del clonado de ADN. Muchos de estos métodos se fundamentan en la recombinación entre el inserto y el vector destino. El sistema Gateway ® de Invitrogen, por ejemplo, necesita para su funcionamiento de un vector especial adaptado para el clonado. Por otro lado, el sistema In-Fusion ™ de Clontech puede ser usado con cualquier vector aunque requiere que este sea previamente linealizado por PCR 29–31 .
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Caenorhabditis elegans como modelo para estudiar el metabolismo de colesterol : autofagia y efecto del aceite de kril

Caenorhabditis elegans como modelo para estudiar el metabolismo de colesterol : autofagia y efecto del aceite de kril

Uno de los factores que ayuda a mantener la homeostasis celular es el equilibrio entre la síntesis y la degradación de proteínas. Desde que se descubrió la ubiquitinación, las proteínas de vida corta fueron un objeto de estudio muy relevante. Sin embargo, más del 99% de las proteínas celulares son de vida relativamente larga. La vida media de las proteínas puede consistir en unos pocos minutos a más de diez días. Usualmente, una proteína de vida larga es aquella con una vida media de más de cinco horas [11]. La mayor parte de estas proteínas son degradadas en un compartimento lítico, como son el lisosoma o la vacuola. La macroautofagia, o solamente autofagia, es la ruta principal por la cual el citoplasma celular es secuestrado en un compartimento lítico, por una “membrana de aislamiento” (Fig 1.5). Esto resulta en la formación de una estructura de doble membrana llamada autofagosoma (Fig 1.5), que eventualmente se fusiona con el lisosoma o la vacuola para ser degradado (Fig 1.5). En mamíferos, la autofagia es inducida por la falta de nutrientes como el nitrógeno, el carbono, el sulfato o el fosfato [11].
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AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE ANTIOXIDANTE DO EXTRATO DE JABUTICABA (MYRCIARIA CAULIFLORA) NO MODELO EXPERIMENTAL CAENORHABDITIS ELEGANS

AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE ANTIOXIDANTE DO EXTRATO DE JABUTICABA (MYRCIARIA CAULIFLORA) NO MODELO EXPERIMENTAL CAENORHABDITIS ELEGANS

O estresse oxidativo pode ser compreendido como um desequilíbrio entre a produção de espécies reativas e as defesas antioxidantes do organismo, sendo que este desbalanço origina danos teciduais que, ao se acumularem, geram distúrbios em uma escala maior. Os radicais livres apresentam papel importante neste processo, pois devido ao seu elétron desemparelhado tornam-se extremamente reativos, permitindo interação com lipídios, proteínas, açucares e DNA em diversos mecanismos (CAMMERER, 2012). Para contrapor estes danos, as defesas antioxidantes atuam com o objetivo de manter a homeostasia e a função normal do organismo. Estas dividem-se em dois grupos: os enzimáticos que compreendem complexos enzimáticos como glutationa peroxidase, catalase e superóxido dismutase; e os não-enzimáticos que englobam vitaminas e compostos antioxidantes provenientes da dieta. Quando associados estes dois grupos conferem uma maior proteção aos tecidos (FERREIRA, 2009).
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OS BENEFÍCIOS DA SUBSTITUIÇÃO DO THEOBROMA CACAU PELO CERATONIA SILIQUA USANDO COMO MODELO CAENORHABDITIS ELEGANS

OS BENEFÍCIOS DA SUBSTITUIÇÃO DO THEOBROMA CACAU PELO CERATONIA SILIQUA USANDO COMO MODELO CAENORHABDITIS ELEGANS

Observamos que a alfarroba e o cacau apresentam algumas diferenças importantes na composição bromatológica (Tabela 1). Ambos apresentam quantidades semelhantes de umidade e minerais, mas a alfarroba apresenta uma quantidade significativamente maior de proteínas e menor de lipídios em comparação com o cacau. Portanto, além das vantagens de não ter cafeína na composição, a alfarroba ainda tem mais proteínas e menos lipídios, o que é uma grande vantagem frente ao cacau. Além disso, a alfarroba apresenta um maior conteúdo de compostos fenólicos totais quando comparado com o cacau, sendo considerada mais antioxidante.
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Silenciamiento génico postranscripcional: Mecanismo de defensa antiviral en plantas / Post transcriptional gene silencing: antiviral defensive mechanism in plants

Silenciamiento génico postranscripcional: Mecanismo de defensa antiviral en plantas / Post transcriptional gene silencing: antiviral defensive mechanism in plants

Las ARN polimerasas dependientes de ARN (RdRps, del inglés RNA dependent RNA polyme- rases) son requeridas para la ruta citoplasmática de silenciamiento de ARN y de la cromatina en Caenorhabditis elegans, hongos y plantas (Cogoni y Macino, 1999; Dalmay et al., 2000; Mourrain et al., 2000; Smardon et al., 2000; Sijen et al., 2001; Volpe et al., 2002; Xie et al., 2004), pero no, apa- rentemente, para la misma ruta en insectos o ani- males. Las RdRp muestran un motivo secuencia común que está lejanamente relacionado con el dominio catalítico de las ARN polimerasas ADN dependientes y es por eso probable que ellas sean un grupo antiguo de proteínas (Iyer et al., 2003). A. thaliana, C. elegans y Neurospora crassa tienen pequeñas familias génicas de RpRds que, como las proteínas AGO, indican diversificación funcional de las rutas de silenciamiento. En A. thaliana, las RpRds RDR1 y RDR6 (conocidas como SDE1 y SGS2, respectivamente) son utilizadas en la ruta de silenciamiento citoplasmática de ARN que si- lencia transgenes y virus. Sin embargo, parece que esas proteínas tienen especificidad por diferentes ARN virales: mutantes de RDR6 en A. thaliana son hipersusceptibles a Cucumber mosaic virus; mientras que plantas de tabaco con reducidos niveles de RDR1 muestran incrementada sus- ceptibilidad a Tobacco mosaic virus (Mourrain et al., 2000; Dalmay et al., 2001; Xie et al., 2001). Mutantes de RDR2 son defectuosos para la pro- ducción de siRNA endógenos, incluyendo a aque- llos que se corresponden con retroelementos. De tal forma, se ha propuesto que la proteína RDR2 podría ser parte de la ruta de silenciamiento de la cromatina (Xie et al., 2004).
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Contribución del Sistema de Secreción Tipo 6 a la interacción del patógeno nosocomial Acinetobacter baumannii con el hospedador usando a Caenorhabditis elegans como modelo de infección

Contribución del Sistema de Secreción Tipo 6 a la interacción del patógeno nosocomial Acinetobacter baumannii con el hospedador usando a Caenorhabditis elegans como modelo de infección

Figura 1.6: Mecanismo de acción del SST6. Se muestran las diferentes etapas del ensamblaje y el modo de acción del SST6. La biogénesis del complejo macromolecular (a, b, c) se puede dividir en dos pasos: al ensamblaje del complejo de membrana y la placa base en el sitio de la secreción (a) seguido del alargamiento de la estructura tubular citoplásmica construida por hexámeros Hcp (rectángulos negros) apilados unos sobre otros acoplados a la polimerización de la vaina TssBC (rectángulos azules) (b, c). Una vez en contacto con una célula blanco, la vaina se contrae, por lo tanto, impulsa el tubo interno hacia la célula blanco para suministrar proteínas efectoras (d). Una hélice α de TssC que sobresale de la vaina contraída recluta la ATPasa ClpV (e) que desmonta y recicla las proteínas de la vaina TssBC (f). Adaptado de Zoued y col., 2014.
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Efecto de la melatonina sobre la longevidad de caenorhabditis elegans

Efecto de la melatonina sobre la longevidad de caenorhabditis elegans

Durante el proceso de envejecimiento en C.elegans, el daño generado se acumula en el nematodo al azar, la exposición al estrés hace que aumenten los niveles de HSP-4 y HSP-16 (proteínas de choque térmico) que aumentan incluso más de lo necesario para reparar el daño, teniendo incluso funciones de protección a largo plazo, aumentando la longevidad y la tolerancia de C.elegans al estrés. La muerte se produce cuando su carga energética es demasiado baja para recuperar los daños causados por el estrés (Zhou K y cols., 2011). Diferentes estudios demuestran que los genes implicados en la vía de señalización de insulina/IGF 1, la vía de la rapamicina y los genes que codifican para las proteínas implicadas en la respiración mitocondrial y enzimas antioxidantes, juegan un papel crítico en la respuesta al estrés y en el envejecimiento. Existe una correlación entre los niveles elevados de enzimas antioxidantes y la resistencia al estrés y longevidad (Zhou K y cols., 2011).
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Efecto de la oxidación por peróxido de hidrógeno sobre la actividad gabaérgica en el nemátodo caenorhabditis elegans.

Efecto de la oxidación por peróxido de hidrógeno sobre la actividad gabaérgica en el nemátodo caenorhabditis elegans.

En los receptores GABA-B es la permeabilidad de K + la que aumenta y transmiten la señal por medio de segundos mensajeros. Actualmente, el empleo de moduladores alostéricos del receptor GABA-B ha sido relevante en estudios dirigidos al tratamiento de trastornos neurológicos y psiquiátricos. Los receptores metabotrópicos GABA-B son heterodímeros con localización pre y postsináptica, donde inhiben la liberación de neurotransmisor y provocan la hiperpolarización, respectivamente. Poseen importantes sitios de modulación alostérica, potencialmente útiles para la clínica. Están asociados a proteínas G (Cortés-Romero et al, 2013).
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The Thioredoxin TRX-1 Modulates the Function of the Insulin-Like Neuropeptide DAF-28 during Dauer Formation in Caenorhabditis elegans

The Thioredoxin TRX-1 Modulates the Function of the Insulin-Like Neuropeptide DAF-28 during Dauer Formation in Caenorhabditis elegans

However, under circumstances in which genes involved in dauer development become inactivated due to mutations, animals arrest as dauers even under favorable conditions (dauer formation constitutive or Daf-c phenotype) [14]. Among the known daf-c genes whose functions are linked to ASJ, four have previously been well characterized for their role in the dauer formation pathway: daf-11 (abnormal dauer formation-11), daf-28, tax-2 (abnormal chemotaxis-2) and tax-4 (Figure S1; [12,15,16,17,18]). Moreover, mutations in these four daf-c genes have also been reported to extend lifespan [19,20,21], providing an additional link between dauer formation and aging. daf-11 encodes a transmembrane guanylyl cyclase, while tax-2 and tax-4 encode subunits of a cyclic guanosine monophosphate (cGMP)-gated ion channel; these three genes are expressed in subsets of amphid sensory neurons, including ASI and ASJ [15,22]. DAF-11 regulates dauer formation by modulating the levels of cGMP in these neurons, to which TAX-2/TAX-4 respond [22], which then regulate the expression of transforming growth factor-beta (TGF-beta) [23] and insulin- like neuropeptides [18,24] (Figure S1). There are ,40 insulin-like neuropeptides in C. elegans (www.wormbase.org), and several, including DAF-28, have been reported to be produced in ASJ, among other neurons [18,24]. To gain insight into whether TRX- 1 plays a role in dauer formation in C. elegans, we analyzed at the cellular and genetic level its interaction with daf-c genes co- expressed in ASJ neurons.
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proteínas

proteínas

Como consecuencia del carácter anfótero de los aminoácidos, y de los distintos tipos de grupo R presentes, las proteínas pueden actuar contrarrestando oscilaciones de pH. De este modo, junto con las sales minerales actúan como soluciones amortiguadoras de pH amortiguadoras de pH, para tratar de mantener a éste dentro de los rangos óptimos del organismo (hay que recordar que el valor óptimo del pH es diferente según la región del cuerpo).

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Fitoextracción de suelos contaminados por elementos potencialmente tóxicos en la región de Atlixco, Puebla

Fitoextracción de suelos contaminados por elementos potencialmente tóxicos en la región de Atlixco, Puebla

Níquel: Helianthus annuus en 120 días> Chrysopogon zizanioides en 120 días > Zinnia elegans en 90 días >Tagetes erecta en 120 días Hierro: Zinnia elegans en 120 días> Helianthus annuus e[r]

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El cerebro de Marmosa Elegans

El cerebro de Marmosa Elegans

Esta explicación muy sugestiva calza fielmente con la disposición de eistos núcleos- olfatorio anterior externo dorsal y ventral en Marmosa elegans, donde se disponen en una línea exacta[r]

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Cromosomas del ciclo celular de Coleonyx elegans elegans (squamata:eublepharidae) de Tabasco, Mexico

Cromosomas del ciclo celular de Coleonyx elegans elegans (squamata:eublepharidae) de Tabasco, Mexico

a especie gecko de bandas Coleonyx elegans elegans se caracteriza por ser una lagartija con bandas muy coloridas en todo su cuer- po dorsal. Se alimenta principalmente de insectos y presenta actividad nocturna y diurna. Es una es- pecie de reptil con importancia biológica, debido a que actúa como controlador biológico de sobrepo- blaciones de insectos, así como importancia ecoló- gica por ser parte de la dieta de aves en la cadena trófica. Los estudios de genética clásica en espe- cies de reptiles en el Estado de Tabasco, México, es inexistente por lo que se realizó un estudio citoge- nético en el gecko de bandas hembra colectado en el Municipio de Tacotalpa. A través de la técnica de citogenética convencional se obtuvieron célu- las en meiosis de tejido gonádico y células en mi- tosis de tejido de médula ósea. Las diferentes fa- ses encontradas del ciclo celular fueron en meiosis I el leptoteno, cigoteno y paquiteno perteneciente a la fase de profase, además de cromosomas biva- lentes en metafase encontrándose 16 cromosomas haploides. En meiosis II se encontraron células en metafase con campos cromosómicos variantes de 26 a 32 cromosomas diploides, permitiendo corre- lacionar filogenéticamente al gecko de bandas con otras especies de la familia Eublepharidae.
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Actividad depredadora in vitro de Lasioseius penicilliger (Arachnida: Mesostigmata) contra tres especies de nemtodos: Teladorsagia circumcincta, Meloidogyne sp  y Caenorhabditis elegans

Actividad depredadora in vitro de Lasioseius penicilliger (Arachnida: Mesostigmata) contra tres especies de nemtodos: Teladorsagia circumcincta, Meloidogyne sp y Caenorhabditis elegans

En este momento, sólo se trata de una especulación, porque los resultados se obtuvieron in vitro y se deben tomar con cautela. Por otro lado, el hecho de que L. penicilliger haya actuado contra C. elegans (un nemátodo de vida libre) podría ser una característica indeseable. Falta mucho por estudiar para establecer con precisión el potencial de los ácaros como agentes de control biológico, ya que L. penicilliger es capaz de alimentarse tanto de nemátodos parásitos de animales como de nemátodos parásitos de plantas.

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Intracellular amyloid formation in muscle cells of A beta transgenic Caenorhabditis elegans: determinants and physiological role in copper detoxification

Intracellular amyloid formation in muscle cells of A beta transgenic Caenorhabditis elegans: determinants and physiological role in copper detoxification

In the present work, we evaluated intrinsic and extrinsic factors on the aggregation of intracellular Aβ peptides constitutively overexpressed in muscle cells of C. elegans. Our results indicate that intracellular Aβ aggregation is selectively affected by single amino acid substitution, which is in agreement with previously published in vitro data [14]. Under our experimental conditions, we find that the NIC mutation (V18A) did form fewer Thiofla- vine-S (ThS)-positive aggregates compared to Aβ wt. Nei- ther non-aggregating Aβ peptide nor aggregating Aβ peptide induced strong paralysis phenotypes in these ani- mals in a wild type background. However, Aβ wild type affected the worms' motility as they aged mimicking the muscle weakness observed in IBM patients. Therefore, we asked the question whether CuCl 2 could modulate the
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The Protein Oxidation Repair Enzyme Methionine Sulfoxide Reductase A Modulates A beta Aggregation and Toxicity In Vivo

The Protein Oxidation Repair Enzyme Methionine Sulfoxide Reductase A Modulates A beta Aggregation and Toxicity In Vivo

FIG. 6. Proposed model. The cartoon shows the early pathological events in the IBM C. elegans model. (A) The accumulation of Ab spe- cies in different states of oligomerization at the neuro- muscular synapse causes an alteration of specific postsyn- aptic molecules, including nAChRs. The oxidative state of Ab Met 35 alters Ab aggre- gation kinetics. (B) During the development of IBM, the ox- idation of Ab-Met 35 may shift the aggregation kinetics to- ward the formation of more toxic oligomeric species. The oxidation of the toxic-soluble oligomers prevents the for- mation of fibrils and, ulti- mately, of less toxic amyloid aggregates. To see this illus- tration in color, the reader is referred to the web version of this article at www.liebertpub .com/ars
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Las proteínas

Las proteínas

•Función de transporte: Muchas proteínas se unen con otras moléculas e intervienen en su transporte. Así tenemos algunas proteínas de las membranas celulares (permeasas) que tienen como función transportar sustancias entre el exterior y el interior. Otras muchas proteínas extracelulares tienen como misión transportar diversas sustancias por el interior del organismo, así tenemos la hemoglobina que transporta el oxígeno en la sangre de los vertebrados, la hemocianina lo hace en algunos invertebrados, la mioglobina lo transporta en el músculo; los citocromos transportan electrones en la cadena respiratoria (mitocondrias) y en la fase luminosa de la fotosíntesis (cloroplastos); las lipoproteínas transportan colesterol, triglicéridos y otros lípidos; la seroalbúmina transporta ac.grasos, fármacos y otras sustancias en la sangre.
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Caenorhabditis elegans : Señalización de CA2+ en la faringe

Caenorhabditis elegans : Señalización de CA2+ en la faringe

pone otro encima, apretamos suavemente para que se extienda la gota y lo dejamos enfriar un par de minutos. Pasado el tiempo se separan los dos cubreobjetos con mucho cuidado para quedarnos con una película fina de agar (se denomina “pad”) en uno de ellos. Una vez tenemos el “pad” de agar lo montamos en la cámara de medida, que se ajusta perfectamente a la pletina del microscopio y procedemos a pegar el gusano con Dermabond. El Dermabond es un pegamento de cianocrilato que se utiliza actualmente en clínica para unir heridas de cortes o cirujías, y por tanto no es tóxico ni para humanos ni para el C. elegans. Se empieza a pegar desde la cola y progresivamente se avanza hacia la boca, sin llegar en ningún momento a tocarla, este proceso se realiza con mucho cuidado con ayuda de pipetas de Patch-Clamp que tienen la punta muy fina. Se añaden 300ml de serotonina 5mg/ml, preparada diariamente (Horvitz, 1982) en tampón M9, para estimular el bombeo de la faringe durante el experimento. La serotonina simula la presencia de comida y estimulan el bombeo. Se monta la cámara en el microscopio, Zeiss Axiovert 200 microscopio de fluorescencia invertido.
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LAS PROTEÍNAS EN LA NUTRICIÓN

LAS PROTEÍNAS EN LA NUTRICIÓN

Existen muchas clasificaciones de las proteínas, dependiendo de su estructura, función, solubilidad, forma, etc., pero una clasificación general para estas, las divide en: globulares y fibrosas, las primeras son de forma esférica o parecida a ésta, contienen en su estructura hélices α y hebras β, además de estructuras no repetitivas (asas y giros) las cuales les proporcionan diseños compactos con funciones particulares, son solubles en agua; algunos ejemplos son: la insulina, albúmina, globulinas plasmáticas y numerosas enzimas. Las proteínas fibrosas son de forma alargada, su armazón es una repetición de elementos de estructura secundaria (hélices α y hebras β), éstas le confieren la forma de fibras cilíndricas observables al microscopio, son de baja solubilidad en agua, dentro de éstas se encuentran la queratina, miosina, colágeno y fibrina (2).
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Aminoácidos y proteínas

Aminoácidos y proteínas

Huevos Ninguno Maíz Triptófano Carne de res Ninguno Legumbres Metionina Queso Metionina Soya Metionina3. Aminoácidos y proteínas.[r]

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